Non, l'instruction du permis relève de l'administration, pas de vous. Le retard d'instruction ne vous est pas imputable si vous n'exécutez pas des travaux non autorisés.
Les articles R. 423-23 et R. 462-1 du Code de l'urbanisme encadrent le délai d'instruction, généralement de deux mois pour un modificatif. Ce délai dépend de l'administration. Votre responsabilité serait engagée si vous réalisiez des adaptations sans autorisation ; en respectant l'attente, le retard est extérieur à votre entreprise.
Un couvreur ne peut modifier la pente de toiture avant l'obtention du permis modificatif. Il montre au maître d'ouvrage que l'instruction dépasse le délai administratif, écartant sa responsabilité dans le report.